清水河县因境内有清水河而得名,地处内蒙古高原和黄土高原交接地带,境内山地最多,滩川地甚少,整个地形是山、川、沟相间,山峦起伏,主要山脉有盘山、玉屏山、金盖山、银矿山、火石山、青龙洞山、馒头山、芦草山、紫金山。摇林沟自然保护区位于清水河县东南部,野生动植物资源丰富,狐狸、獾、兔、狼、黄鼠、鹰、啄木鸟等常出没于此。