位于佛顶山上，是普陀山海拔最高的寺院。全寺四面环山，隐于浓荫翠绿之中，主殿顶用天蓝、淡绿、鹅黄、紫红等彩色琉璃瓦盖成，亮点也就在这里，据说在太阳的照射下很漂亮，很像佛光。明万历、清康熙、清嘉庆所赐的三枚御印现就藏于慧济寺，是慧济寺的镇寺之宝。全寺布局为其它禅林所少见，天王殿后，大雄宝殿、大悲殿、藏经楼、玉皇殿、方丈室等均在一条平行线上，颇具浙东园林建筑风格。
