保护区所在的这片滩涂受海洋气候影响，气候温和，雨量充沛，四季分明。滩涂上河道港汊纵横交错成网，多沼泽。历史上古长江和黄河长期在该保护区内的南北两端入海，形成了现在20多万公顷的沙洲。独特的自然地理环境蕴育着种类繁多的野生动物及莎草科、禾本科等植物。区内芦苇茂密，绿草如茵。整个保护区象一块绿色的毛毯漂浮在黄海边上，被世界生态学家誉为禽鸟的“王国”，生态保护的典范。 在保护区的各种珍禽中以丹顶鹤（Grus japonesis）的知名度最高，丹顶鹤属鹤形目、鹤科，为世界上濒临灭绝的珍稀鸟，被列为我国一类重点保护鸟类。其幼鸟为早成雏，成体体羽洁白，尾羽黑色，头部裸露部赤红色，眼前大都被羽，后趾形小而位高，和其他三趾不在一个平面上。其气管特别长，而且穿入胸骨内，盘曲多圈，这种结构在鸟类中是罕见的。我国人民自古以来多喜爱丹顶鹤，因它体形优美、秀丽；动作娴雅、洒脱，被誉之为“仙鹤”，视其为吉祥、长寿、忠贞的象征。常见画家作有“松鹤长寿图”，其实鹤不栖落于松树上，而是常涉行于浅滩沼泽或田野中，啄食鱼虾、嫩草、谷粒等。
