拥有1400多年历史，清初固反清复明被毁灭。1986-1988年全国文物普查期间，其遗址被发现，并经有关专家论证确认。经福建省人民政府批准，南少林首期重建工程历经回年，于1998年12月全部竣工，共建成大碑楼、盘山进寺公路、大雄宝殿、天王殿、钟鼓楼、长廊、僧舍放生池、山门、护寺13护寺桥等十多个项目，耗资8000 万元，莆田南少林寺迄今已连续举办五届南少林拳大比赛。每年举办莆田南少林武术文化旅游节 。
