由于波斯尼亚的人口结构由波斯尼亚大多数人的混合人口、塞族和克罗地亚少数民族组成，波斯尼亚大面积地区的所有权存在争议。

从1991年到1992年，多民族波斯尼亚和黑塞哥维那的局势变得紧张。它的议会在种族方面分散为多个波斯尼亚派和少数塞族和克罗地亚派别。1991年，塞尔维亚民主党最大的塞族派系领导人拉多万·卡拉季奇向波斯尼亚议会发出严厉直接的警告，如果它决定分开，他说：

这，你所做的，并不好。这条路是你想带波斯尼亚和黑塞哥维那走的，就像斯洛文尼亚和克罗地亚走的一样。不要以为你不会把波斯尼亚和黑塞哥维那带进地狱，穆斯林可能会灭绝。因为如果这里有战争，穆斯林人民就不能自卫。

与此同时，在幕后，米洛舍维奇和图曼之间开始谈判，将波斯尼亚和黑塞哥维那分为塞族和克罗地亚管辖地区，以试图避免波斯尼亚克族人和塞尔维亚人之间的战争。波斯尼亚塞族人于1991年11月举行全民投票，结果以压倒性的票数赞成与塞尔维亚和黑山保持共同的状态。

在公开场合，塞尔维亚的亲州媒体向波斯尼亚人宣称，波斯尼亚和黑塞哥维那可以在新的南斯拉夫民主政府的基础上成为一个新的自愿联盟，但波斯尼亚和黑塞哥维那政府并没有认真对待这一点。

1992年1月9日，波斯尼亚塞族议会宣布独立的波斯尼亚和黑塞哥维那塞族人民共和国（即将成为斯普斯卡共和国），并在整个州内建立了塞尔维亚自治区（SAR）。波斯尼亚和黑塞哥维那政府宣布塞尔维亚关于留在南斯拉夫的公民投票和特区的建立违宪。

1992年2月29日和3月1日举行了由波斯尼亚政府主办的关于独立的公民投票。联邦宪法法院和新成立的波斯尼亚塞族政府宣布全民投票违反波斯尼亚和联邦宪法，并且在很大程度上抵制了公民投票。波斯尼亚塞族人。根据官方结果，投票率为63.4％，99.7％的选民投票支持独立。目前还不清楚三分之二的多数要求实际上意味着什么，是否得到满足。

波斯尼亚和黑塞哥维那于1992年3月3日宣布独立，并于1992年4月6日在获得国际承认。在同一天，塞族人宣布塞族共和国独立，并围攻萨拉热窝，这标志着波斯尼亚战争的开始。波斯尼亚和黑塞哥维那共和国随后于1992年5月22日被接纳为联合国会员国。